6-Fluoroquinazoline-2,4-diol ถูกนำมาใช้หลักในสาขาเคมีทางการแพทย์และการวิจัยเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพหลากหลาย โดยเฉพาะสารที่มุ่งเป้าการยับยั้งเอนไซม์ โครงสร้างของมันมักถูกนำมาใช้ในการพัฒนายาต้านมะเร็ง เนื่องจากสามารถนำไปรวมในโมเลกุลที่ออกแบบมาเพื่อยับยั้ง tyrosine kinases ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการเพิ่มจำนวนเซลล์มะเร็ง นอกจากนี้ สารประกอบนี้ยังถูกสำรวจสำหรับศักยภาพในการสร้างยาต้านจุลชีพ เนื่องจากความสามารถในการรบกวนกระบวนการจำลองและซ่อมแซม DNA ของแบคทีเรีย นักวิจัยยังศึกษาการนำไปใช้ในการออกแบบยารักษาโรคอักเสบและโรคภูมิต้านตนเอง เนื่องจากศักยภาพในการปรับเปลี่ยนเส้นทางชีวเคมีเฉพาะเจาะจง โดยรวมแล้ว ความหลากหลายของมันทำให้เป็นส่วนประกอบพื้นฐานที่มีคุณค่าต่อการค้นพบและพัฒนายา