6-(Bromomethyl)-4-chloroquinazoline ถูกนำมาใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะสารกลางที่หลากหลายสำหรับการสร้างอนุพันธ์ quinazoline ที่ซับซ้อนมากขึ้น กลุ่ม bromomethyl ที่ทำปฏิกิริยาได้ของมันช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการแทนที่นิวคลีโอไฟล์ ทำให้มีคุณค่าต่อการพัฒนายา โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการสังเคราะห์ตัวยับยั้ง kinase และยาต้านมะเร็ง สารประกอบนี้ยังถูกนำมาใช้ในการเตรียมโมเลกุลที่ biologically active ที่มุ่งเป้าไปยังโรคต่าง ๆ โดยใช้ประโยชน์จากความสามารถในการนำเข้าชนิดฟังก์ชันที่ตำแหน่งเฉพาะบนแกน quinazoline นอกจากนี้ยังทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบหลักในงานวิจัยทางเคมียารักษาโรคสำหรับการออกแบบและปรับปรุงยาที่มีคุณสมบัติทางรักษาที่ดีขึ้น