4-Chloro-6,7-difluoro-2-methylquinazoline เป็นสารเคมีที่ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม มันถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นหรือสารกลางในการผลิตยาต้านมะเร็งและยาต้านจุลชีพ เนื่องจากโครงสร้างของมันมีส่วนช่วยในการออกแบบโมเลกุลที่มีความจำเพาะต่อเป้าหมายทางชีวภาพ นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาการนำไปใช้ในการพัฒนายาใหม่ๆ ที่มีฤทธิ์ยับยั้งเอนไซม์หรือโปรตีนเฉพาะทาง ซึ่งอาจนำไปสู่การรักษาโรคต่างๆ ที่ซับซ้อนมากขึ้น