4,8-Dichloro-6-fluoroquinazoline เป็นสารเคมีที่ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารออกฤทธิ์ทางยา โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม มักถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นหรือ intermediate ในการผลิตยาต้านมะเร็งและยาต้านจุลชีพ เนื่องจากโครงสร้าง quinazoline ที่มีส่วนประกอบของคลอรีนและฟลูออรีนช่วยเพิ่มประสิทธิภาพในการยับยั้งเอนไซม์หรือโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตของเซลล์มะเร็งหรือเชื้อโรค นอกจากนี้ยังมีการศึกษาเพื่อนำไปใช้ในงานวิจัยทางเคมีเภสัชกรรมเพื่อพัฒนายาใหม่ๆ ที่มีประสิทธิภาพสูงและมีผลข้างเคียงน้อยลง