2-Chloro-7-iodoquinazoline ใช้หลักในการวิจัยและพัฒนายาเภสัช โดยเป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพหลากหลาย โครงสร้างของมันทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีคุณค่าในการสร้างอนุพันธ์ควิที่นาซโอลีน ซึ่งมักถูกสำรวจเพื่อคุณสมบัติทางรักษาที่มีศักยภาพ สารนี้มีความสำคัญอย่างยิ่งในการออกแบบและพัฒนายับยั้งคินาส ซึ่งจำเป็นในการกำหนดเป้าหมายเอนไซม์เฉพาะที่เกี่ยวข้องกับมะเร็งและโรคอื่นๆ นอกจากนี้ ยังใช้ในเคมียารักษาเพื่อเตรียมสารประกอบที่อาจแสดงฤทธิ์ต้านจุลชีพ ต้านการอักเสบ หรือต้านไวรัส โครงสร้างที่มีฮาโลเจนช่วยให้สามารถปรับแต่งเพิ่มเติม ทำให้เป็นส่วนประกอบที่หลากหลายในการสังเคราะห์อินทรีย์และกระบวนการค้นพบยา