ใช้ในงานวิจัยและพัฒนายา โดยเฉพาะในกลุ่มยารักษาโรคมะเร็ง เนื่องจากโครงสร้างของควินาโซลีนสามารถยับยั้งการทำงานของโปรตีนคินาส ซึ่งเกี่ยวข้องกับการแบ่งตัวของเซลล์ การอักเสบ และการเติบโตของเส้นเลือดใหม่ในเนื้องอก นอกจากนี้ยังใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบอนุพันธ์ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านจุลชีพ ยาต้านไวรัส และยาแก้อักเสบ นิยมใช้ในห้องปฏิบัติการวิจัยเพื่อศึกษาโครงสร้าง-กิจกรรมของสารออกฤทธิ์