6-Methylquinazoline-2,4(1H,3H)-dione ถูกใช้หลักในการวิจัยและพัฒนายาเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพหลากหลาย โดยเฉพาะสารที่มุ่งเป้าไปยังการยับยั้งเอนไซม์ โครงสร้างของมันมีคุณค่าสำหรับการออกแบบโมเลกุลเพื่อการประยุกต์ใช้ทางบำบัดที่เป็นไปได้ เช่น สารต้านมะเร็งและสารต้านจุลชีพ นอกจากนี้ ยังมีการสำรวจในการพัฒนายาใหม่สำหรับโรคทางระบบประสาท เนื่องจากความสามารถในการโต้ตอบกับเส้นทางชีวภาพเฉพาะ นักวิจัยยังนำมาใช้ในการศึกษาที่เกี่ยวข้องกับการเมแทบอลิซึมของยาและเภสัชจลนศาสตร์ เพื่อทำความเข้าใจพฤติกรรมของมันในระบบชีวภาพ การประยุกต์ใช้ขยายไปสู่ศาสตร์วัสดุศาสตร์ ซึ่งมีการตรวจสอบศักยภาพในการสร้างวัสดุอินทรีย์ขั้นสูงที่มีคุณสมบัติอิเล็กทรอนิกส์หรือโฟโตนิกเฉพาะ