4-Chloro-7-fluoroquinazoline ถูกใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมเป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพต่างๆ การประยุกต์ใช้หลักอยู่ในกระบวนการพัฒนายาต้านมะเร็ง โดยเฉพาะยับยั้งไทโรซีนไคเนส ซึ่งเล็งเป้าไปที่เอนไซม์เฉพาะที่เกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตและการแพร่กระจายของเซลล์มะเร็ง โครงสร้างของสารช่วยให้สามารถปรับแต่งเพิ่มเติมเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความเลือกสรรของยา นอกจากนี้ยังใช้เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสร้างอนุพันธ์ควิที่นาซโอลีนอื่นๆ ซึ่งถูกสำรวจสำหรับศักยภาพในการรักษาโรค เช่น ความดันโลหิตสูง การอักเสบ และการติดเชื้อแบคทีเรีย ความหลากหลายในเคมีเภสัชกรรมทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีค่าในกระบวนการค้นพบและพัฒนายา