เอทิล 6-โบรโมไพร์โรโล[1,2-c]ไพรีมีดีน-3-คาร์บ็อกซิเลต ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์และการวิจัยเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นตัวกลางสำคัญในการพัฒนาสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพหลากหลาย โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์สารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิก ซึ่งมักถูกสำรวจเพื่อคุณสมบัติทางรักษาที่มีศักยภาพ นักวิจัยใช้สารเคมีนี้ในการสร้างโมเลกุลใหม่ที่อาจแสดงฤทธิ์ต้านมะเร็ง ต้านไวรัส หรือต้านการอักเสบ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการออกแบบตัวยับยั้งที่กำหนดเป้าหมายไปยังเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะ ซึ่งมีส่วนช่วยในการค้นพบยา ความหลากหลายในการทำปฏิกิริยาเคมีทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในการสร้างโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนในเคมียารักษา