สารประกอบนี้ถูกนำมาใช้เป็นหลักในสาขาเคมีทางการแพทย์และการวิจัยทางเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลชีวภาพที่ active หลากหลาย โดยเฉพาะอย่างยิ่งที่มุ่งเป้าไปยังเอนไซม์ kinase โครงสร้างของมันมักถูกผสมผสานในการออกแบบตัวยับยั้งสำหรับ kinase เฉพาะเจาะจงที่เกี่ยวข้องกับโรคมะเร็ง การอักเสบ และโรคภูมิต้านตนเอง นักวิจัยใช้โครงสร้างหลัก (scaffold) เพื่อพัฒนาสารที่แรงและเลือกสรรได้ ซึ่งสามารถปรับเปลี่ยนเส้นทางการส่งสัญญาณในเซลล์ นอกจากนี้ ยังถูกสำรวจในการพัฒนายาต้านไวรัส โดยส่วน pyrrolopyrimidine มีบทบาทสำคัญในการจับกับโปรตีนไวรัสและยับยั้งการทำงานของมัน การประยุกต์ใช้ขยายไปสู่โครงการค้นพบยาเพื่อค้นหายารักษาใหม่สำหรับโรคที่ซับซ้อน