ใช้ในงานวิจัยทางเภสัชกรรมเป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะตัวยับยั้งคินาส โครงสร้างอะซาอินโดลสนับสนุนการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังมะเร็งและโรคอักเสบ ใช้กันอย่างแพร่หลายในเคมีทางการแพทย์สำหรับการปรับเปลี่ยนโครงสร้างหลักในออกแบบสารประกอบเฮเตอโรไซคลิก นอกจากนี้ยังนำมาใช้ในการเตรียมโพรบเรืองแสงเนื่องจากคุณสมบัติทางโฟโตฟิสิกส์ที่ดี และทำหน้าที่เป็นหน่วยย่อยก่อสร้างในเคมีแบบผสมผสานสำหรับห้องสมุดการคัดกรองแบบความเร็วสูง