ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่มีโครงสร้างเป็นสารฮีเทอโรไซคลิก โดยเฉพาะในงานวิจัยและพัฒนายาที่ต้องการโมเลกุลที่มีโครงสร้างซับซ้อน เช่น สารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพต่อระบบประสาทส่วนกลาง หรือสารยับยั้งเอนไซม์เฉพาะชนิด เนื่องจากโครงสร้างของมันสามารถทำหน้าที่เป็นตัวทำให้เกิดกรอบโครงสร้างหลัก (scaffold) ในการสร้างสารใหม่ได้อย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ยังนิยมใช้ในขั้นตอนการป้องกันหมู่ฟังก์ชัน (protecting group strategy) โดยหมู่ Boc จะช่วยป้องกันไนโตรเจนไม่ให้ทำปฏิกิริยาในขั้นตอนอื่น ซึ่งช่วยเพิ่มความเลือกสรรถูกต้องในการสังเคราะห์สารหลายขั้นตอน