ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่มีโครงสร้างเป็นสารเฮเทอโรไซคลิก โดยเฉพาะในงานวิจัยและพัฒนายาที่ต้องการโมเลกุลที่มีโครงสร้างเฉพาะเจาะจง ทำหน้าที่เป็นตัวตั้งต้น (intermediate) ในการสร้างสารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น สารต้านจุลชีพ หรือสารปรับการทำงานของระบบประสาท เนื่องจากโครงสร้างที่มีหมู่ Boc ช่วยป้องกันไนโตรเจนไม่ให้ทำปฏิกิริยาในขั้นตอนต่าง ๆ ได้ ทำให้ควบคุมทิศทางของปฏิกิริยาเคมีได้อย่างแม่นยำ ส่วนเกลือไฮโดรคลอไรด์ช่วยเพิ่มความเสถียรและละลายน้ำได้ดีขึ้นในขั้นตอนการประมวลผล