5-Bromo-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-amine hydrochloride ถูกใช้อย่างกว้างขวางในงานวิจัยทางเคมีและเภสัชวิทยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากโครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์และความสามารถในการทำปฏิกิริยากับโมเลกุลเป้าหมายต่างๆ สารนี้มักถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นหรือตัวกลางในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีศักยภาพในการรักษาโรค เช่น โรคมะเร็ง โรคทางระบบประสาท และโรคติดเชื้อ นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาการนำไปใช้ในกระบวนการทางเคมีเพื่อปรับปรุงประสิทธิภาพและความเฉพาะเจาะจงของยา