3-Iodo-4-methoxy-1H-pyrrolo[3,2-c]pyridine ถูกนำมาใช้หลักๆ ในงานวิจัยและพัฒนาพเภสัชกรรมเนื่องจากโครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ ซึ่งทำให้เป็นสารตั้งต้นที่มีคุณค่าในการสังเคราะห์โมเลกุลชีวภาพหลากหลาย มันมักถูกใช้ในการสร้างยาที่มีศักยภาพในการกำหนดเป้าหมายเส้นทางชีวภาพเฉพาะ โดยเฉพาะในสาขามะเร็งวิทยาและโรคทางระบบประสาท ส่วนของไอโอดีนช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันเพิ่มเติมได้ ซึ่งช่วยให้นักเคมีปรับเปลี่ยนโมเลกุลเพื่อเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพหรือปรับปรุงคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ นอกจากนี้ยังใช้ในเคมีทางการแพทย์เพื่อสำรวจความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม (SAR) และปรับปรุงสารนำสำหรับการประยุกต์ใช้ในการบำบัด รวมถึงการศึกษาวิจัยในเคมีอินทรีย์เพื่อพัฒนาวิธีการสังเคราะห์ใหม่ที่มีประสิทธิภาพ