5H-Pyrrolo[2,3-b]pyrazine หลักๆ แล้วถูกนำมาใช้ในงานวิจัยและพัฒนายา โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลที่ออกฤทธิ์ทางชีวภาพต่างๆ โครงสร้างของสารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสร้างยาที่เล็งเป้าไปที่ความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลาง รวมถึงการรักษาที่มีศักยภาพสำหรับโรคซึมเศร้า ความวิตกกังวล และโรคเสื่อมถอยของระบบประสาท นอกจากนี้ ยังมีการสำรวจเพื่อพัฒนายาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง เนื่องจากความสามารถในการโต้ตอบกับเอนไซม์และตัวรับเฉพาะเจาะจง โดยเฉพาะศักยภาพในการยับยั้งเอนไซม์หรือโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตของเซลล์มะเร็ง ในด้านวิทยาศาสตร์วัสดุ สารนี้มีส่วนช่วยในการออกแบบเซมิคอนดักเตอร์อินทรีย์และวัสดุออปโตอิเล็กทรอนิกส์ ซึ่งช่วยเพิ่มประสิทธิภาพของอุปกรณ์ เช่น ไดโอดแสงสว่างและเซลล์แสงอาทิตย์ กรอบเคมีที่หลากหลายของสารนี้ยังทำให้เหมาะสำหรับการใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์และการเร่งปฏิกิริยา ช่วยในการผลิตโมเลกุลซับซ้อนด้วยความแม่นยำสูง