(2S,4S)-1-Boc-2-cyano-4-fluoropyrrolidine ใช้หลักในการสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในงานวิจัยและพัฒนายาเภสัชกรรม ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการเตรียมสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพต่างๆ รวมถึงผู้สมัครยาใหม่ กลุ่มปกป้อง Boc (tert-butoxycarbonyl) ช่วยให้ความเสถียรในกระบวนการสังเคราะห์ ในขณะที่กลุ่ม cyano และ fluoro สนับสนุนปฏิกิริยาและความสามารถในการสร้างโครงสร้างเคมีที่หลากหลาย สารนี้มักใช้ในการสร้างโครงสร้างพื้นฐาน pyrrolidine ซึ่งพบมากในยารักษาโรคต่างๆ เช่น มะเร็ง โรคระบบประสาท และโรคติดเชื้อ ความจำเพาะทางสเตอรีโอเคมียังทำให้มีคุณค่าในการสร้างสารบริสุทธิ์ทางเอนานติโอเมอร์ เพิ่มประสิทธิภาพและความจำเพาะของผลิตภัณฑ์สุดท้าย