(R)-3-Methylpyrrolidine hydrochloride ถูกนำมาใช้เป็นหลักในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมในฐานะ chiral building block สำหรับการสังเคราะห์ active pharmaceutical ingredients (APIs) ต่างๆ สเตอรีโอเคมีของมันทำให้มีคุณค่าต่อการพัฒนายาที่บริสุทธิ์ทางเอนานติโอเมอร์ โดยเฉพาะยาที่มุ่งเป้าไปยังระบบประสาทส่วนกลาง มันมักถูกใช้ในการผลิตสารประกอบที่มีศักยภาพในการรักษาโรคทางระบบประสาท เช่น โรคพาร์กินสันหรือภาวะซึมเศร้า นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นสารกลางในการสังเคราะห์โมเลกุลที่ซับซ้อนสำหรับการวิจัยเคมียา ช่วยในการค้นพบยาใหม่ๆ รูปแบบ hydrochloride ช่วยเพิ่มความละลาย ทำให้จัดการได้ง่ายขึ้นในปฏิกิริยาเคมีและสูตรยาต่างๆ