(S)-4,4-Difluoropyrrolidine-2-carboxylic acid ใช้เป็นหลักในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมเป็นสารตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพต่างๆ โครงสร้างเฉพาะตัวที่มีวงแหวนไพรโรลิดีนแทนที่ด้วยฟลูออรีนที่ตำแหน่ง 4,4 ทำให้มีคุณค่าต่อการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลาง เช่น โรคพาร์กินสันและโรคอัลไซเมอร์ นอกจากนี้ ยังใช้ในการสร้างตัวยับยั้งโปรตีเอส ซึ่งมีความสำคัญในการรักษาการติดเชื้อไวรัส เช่น HIV และ hepatitis C สเตอรีโอเคมีของสารนี้มีบทบาทสำคัญในการเพิ่มความจำเพาะและประสิทธิภาพของยารักษา ทำให้เป็นหน่วยย่อยก่อสร้างที่มีคุณค่าในเคมีเภสัชกรรม