ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาสารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพและยาที่เป็นผู้สมัครพัฒนา หน้าที่การป้องกันของหมู่อะมีนช่วยให้เกิดปฏิกิริยาที่เลือกสรรในการสังเคราะห์อินทรีย์หลายขั้นตอน ใช้กันทั่วไปในการเตรียมตัวยับยั้งโปรติเอส ตัวยับยั้งคินาส และยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง หมู่อะมีนที่ป้องกันด้วย Boc ช่วยให้ความเสถียรระหว่างปฏิกิริยาและสามารถกำจัด Boc ออกได้ง่ายภายใต้สภาวะกรดอ่อน ทำให้เหมาะสำหรับการก่อสร้างแบบเปปไทด์ในเฟสของแข็งและเฟสของเหลว นอกจากนี้ยังใช้ในการสร้างไลบรารีสำหรับการคัดกรองความเร็วสูงในการค้นพบยา