ใช้ในสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นหรือตัวกลางในการสร้างสารที่มีโครงสร้างเป็นเพปไทด์หรือสารประกอบที่มีไนโตรเจน มักพบในการพัฒนายาที่ต้องการความจำเพาะสูง เช่น ยาต้านไวรัส หรือยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง เนื่องจากโครงสร้างที่มีหมู่ Boc ช่วยป้องกันหมู่อะมิโนระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ ทำให้ควบคุมทิศทางของปฏิกิริยาได้ดี และสามารถถอดหมู่ป้องกันออกได้ง่ายในขั้นตอนต่อมา