ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาสารอนุพันธ์พิร์โรลฟลูออรีนที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ โครงสร้างของมันช่วยสนับสนุนการสร้างสารประกอบที่มีศักยภาพต้านมะเร็ง ต้านการอักเสบ และต้านจุลชีพ ใช้กันทั่วไปในเคมีเภสัชกรรมเป็นฐานในการออกแบบสารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิก นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเกษตรเคมีเพื่อพัฒนาส่วนผสมออกฤทธิ์ใหม่สำหรับสารป้องกันพืช หมู่ฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความสัมพันธ์ในการจับกับโมเลกุลเป้าหมาย ทำให้มีคุณค่าในออกแบบยาแบบมีเหตุผล ด้วยหมู่ฟลูออรีนและเอสเทอร์ ทำให้มีขั้วและทำปฏิกิริยาได้ง่าย เหมาะเป็นสารตั้งต้นในงานวิจัยเคมีเภสัชกรรม