4-Chloro-6-(iso-propyl-d7)-pyrimidine ถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีที่มีความซับซ้อน โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยาหรือสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ ซึ่งมักใช้ในงานวิจัยและพัฒนายาใหม่ๆ นอกจากนี้ยังอาจถูกนำไปใช้ในการศึกษาเกี่ยวกับกลไกการทำงานของยาและปฏิกิริยาเคมีในระดับโมเลกุล เนื่องจากมีไอโซโทปดิวเทอเรียม (d7) ที่ช่วยในการติดตามและวิเคราะห์ผลลัพธ์ของปฏิกิริยาได้อย่างแม่นยำมากขึ้น