สารเคมีนี้ถูกนำมาใช้เป็นหลักในการวิจัยและพัฒนายา โดยเฉพาะในการสังเคราะห์สารประกอบเดยูเทอเรต สารเดยูเทอเรตซึ่งรวมเดยูเทอเรียม (ไอโซโทปของไฮโดรเจนที่หนักกว่า) เข้าไป มีความสำคัญอย่างมากในการค้นพบยา เนื่องจากสามารถปรับปรุงความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ของยาที่มีศักยภาพ กลุ่มไตรฟลูออโรเมทิลช่วยเพิ่ม lipophilicity และ bioavailability ของสารประกอบ ทำให้เป็นสารกลางที่มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่ออกฤทธิ์ทางชีวภาพ นอกจากนี้ โครงสร้างแกนไพรีมีดีนพบได้บ่อยในยารักษาโรคต่างๆ รวมถึงยาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง ซึ่งเน้นย้ำถึงความสำคัญของมันในเคมียารักษา