สารประกอบนี้ถูกนำมาใช้หลักๆ ในด้านการวิจัยและพัฒนายาเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ส่วนประกอบยาสำคัญทางเภสัชกรรม (APIs) ต่างๆ โดยเฉพาะยาที่เล็งเป้าไปยังเส้นทางเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะเจาะจง โครงสร้างของมันที่มีกลุ่มคลอโรและไซยาโนช่วยให้สามารถปรับแต่งเพิ่มเติมได้ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างยารุ่นใหม่ นอกจากนี้ กลุ่มเอทิลที่ติดฉลากด้วยดีเทอเรียม (ethyl-d5) ยังช่วยเสริมการนำไปใช้ในการศึกษาการเผาผลาญ ทำให้ผู้วิจัยสามารถติดตามและวิเคราะห์พฤติกรรมของโมเลกุลยาในระบบชีวภาพได้อย่างแม่นยำยิ่งขึ้น สารประกอบนี้ยังถูกนำไปใช้ในการพัฒนาสารเคมีเกษตร โดยแกนไพริมิดีนช่วยในการออกแบบสารกำจัดวัชพืชหรือยาฆ่าเชื้อราที่มีประสิทธิภาพและความเลือกสรรสูงขึ้น