(2-Chloropyrimidin-5-yl)methanol เป็นสารเคมีที่ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะสารกลางที่หลากหลายสำหรับการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น มักใช้ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมสำหรับการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) โดยเฉพาะในการสังเคราะห์สารประกอบที่ขึ้นอยู่กับไพรีมีดีน สารประกอบเหล่านี้มีชื่อเสียงในด้านกิจกรรมทางชีวภาพและมักถูกสำรวจสำหรับศักยภาพในการรักษาโรคต่างๆ รวมถึงมะเร็งและการติดเชื้อไวรัส

ในเคมียารักษา มันทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับการออกแบบตัวยับยั้งที่มุ่งเป้าไปยังเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะ โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนเพื่อเพิ่มคุณสมบัติคล้ายยา เช่น ตัวทำละลาย ความเสถียร และความสัมพันธ์ในการจับ นอกจากนี้ ยังใช้ในการวิจัยเกษตรเคมีเพื่อพัฒนายาฆ่าแมลงหรือสารกำจัดวัชพืชใหม่ โดยใช้แกนไพรีมีดีนสำหรับการโต้ตอบกับเป้าหมายทางชีวภาพในศัตรูพืชหรือวัชพืช

ความตอบสนองของสารประกอบ โดยเฉพาะที่กลุ่มคลอโรไพรีมีดีนและกลุ่มไฮดรอกซิล ทำให้มีคุณค่าต่อปฏิกิริยาการจับคู่ เช่น การทดแทนนิวคลีโอฟิลิกหรือกระบวนการครอสคัปพลิง ซึ่งช่วยให้สามารถสร้างห้องสมุดสารเคมีที่หลากหลายสำหรับการคัดกรองและการปรับปรุง