Pyrimidine-4,6-ไดคาร์โบนิไตรล์ ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรมต่างๆ เนื่องจากโครงสร้างทางเคมีที่หลากหลายและยืดหยุ่น มันทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตยาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง โดยกลุ่มไดคาร์โบนิไตรล์ช่วยอำนวยในการก่อตัวของโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการสร้างสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าเชื้อรา ซึ่งความสามารถในการทำปฏิกิริยาช่วยในการออกแบบสารประกอบที่เล็งเป้าไปยังเส้นทางชีวภาพเฉพาะในศัตรูพืชและเชื้อรา ในด้านวิทยาศาสตร์วัสดุ สารประกอบนี้ถูกใช้ในการสังเคราะห์เซมิคอนดักเตอร์อินทรีย์และโพลิเมอร์นำไฟฟ้า ซึ่งมีส่วนช่วยในการพัฒนาอุปกรณ์อิเล็กทรอนิกส์และเซ็นเซอร์ ความสามารถในการทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างสำหรับสารประกอบเฮเทโรไซคลิกทำให้มีคุณค่าการสังเคราะห์อินทรีย์ สามารถสร้างสารเคมีหลากหลายสำหรับการวิจัยและการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรม