สารเคมีนี้ถูกใช้หลักๆ เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชกรรมต่างๆ โครงสร้างของมันทำให้มีคุณค่าในการผลิตยาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง โดยทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบหลักสำคัญ นอกจากนี้ ยังถูกนำไปใช้ในการพัฒนาสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการสร้างสารกำจัดวัชพืชและสารกำจัดเชื้อรา แกนไพรีมีดีนของมันจำเป็นสำหรับการจับกับเป้าหมายทางชีวภาพเฉพาะ ซึ่งช่วยเพิ่มประสิทธิภาพของผลิตภัณฑ์สุดท้าย นักวิจัยยังนำไปใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อสำรวจปฏิกิริยาเคมีและเส้นทางใหม่ๆ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในกระบวนการผลิตยาที่มีฤทธิ์ยับยั้งเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องกับการแบ่งตัวของเซลล์มะเร็ง