2,4-Dichloro-6-fluoropyrimidine เป็นสารเคมีที่ใช้เป็นสารตั้งต้นหรือ intermediate ในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะอย่างยิ่งในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและการเกษตร มันมีบทบาทสำคัญในการพัฒนาสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ เช่น ยาต้านเชื้อรา ยาต้านแบคทีเรีย ยาต้านไวรัส และยาต้านมะเร็ง โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำการปรับแต่งเพิ่มเติมได้ ทำให้มีคุณค่าในการออกแบบและปรับปรุงยาในเคมียารักษาโรค นอกจากนี้ ยังใช้ในการผลิตสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง ซึ่งช่วยในการป้องกันพืชและเพิ่มประสิทธิภาพการเกษตร ความสามารถในการทำปฏิกิริยากับนิวคลีโอไฟล์ต่างๆ ช่วยในการสร้างโมเลกุลซับซ้อนสำหรับการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรมหลากหลาย รวมถึงการวิจัยและพัฒนายาใหม่ๆ เพื่อศึกษาคุณสมบัติทางเคมีและชีวภาพ