ใช้เป็นสารตั้งต้นหลักในการวิจัยและพัฒนายาในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม สารนี้ช่วยในการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพหลากหลาย โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการสร้างสารประกอบที่เล็งเป้าไปยังเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะ ทำให้มีประโยชน์ในการค้นพบยาสำหรับโรคต่าง ๆ เช่น มะเร็ง การอักเสบ และโรคติดเชื้อ นอกจากนี้ ยังนำไปใช้ในงานวิจัยสารเคมีเกษตรเพื่อพัฒนายาฆ่าแมลงหรือสารกำจัดวัชพืชใหม่ โดยใช้แกนไพรีมีดีนเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความจำเพาะเจาะจง ความหลากหลายในการเกิดปฏิกิริยาเคมียังทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในการสังเคราะห์อินทรีย์สำหรับการสร้างโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน