4,5-Dichloropyrimidin-2-amine ถูกใช้หลักๆ ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเกษตรเคมีเป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบต่างๆ ในเภสัชกรรม สารนี้ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการพัฒนายา โดยเฉพาะยาที่เล็งเป้าไปยังเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะ โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถสร้างโมเลกุลที่มีศักยภาพต้านไวรัส ต้านแบคทีเรีย หรือต้านมะเร็ง ในด้านเกษตรเคมี สารนี้ถูกนำไปใช้ในการผลิตยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช ซึ่งช่วยเพิ่มประสิทธิภาพของผลิตภัณฑ์เหล่านี้ในการควบคุมศัตรูพืชและวัชพืช นอกจากนี้ ยังมีการนำไปใช้ในงานวิจัยและพัฒนาเพื่อสร้างสารเคมีใหม่ๆ ที่มีศักยภาพทางรักษาโรคหรือประโยชน์ทางเกษตร