2-Chloro-N-(3-(methylthio)phenyl)pyrimidin-4-amine เป็นสารเคมีที่นำมาใช้เป็นหลักในสาขาการสังเคราะห์อินทรีย์และการวิจัยเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการพัฒนาสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพหลากหลาย โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์โมเลกุลที่เล็งเป้าไปยังเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะเจาะจง ทำให้มีประโยชน์ในการค้นพบยา นอกจากนี้ ยังมีการสำรวจศักยภาพในการสร้างสารเคมีเกษตร เช่น สารกำจัดวัชพืชหรือยาฆ่าเชื้อ เนื่องจากความสามารถในการรบกวนกระบวนการทางชีวภาพในศัตรูพืชหรือพยาธิ นักวิจัยยังนำมาใช้ในการศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างและกิจกรรม ซึ่งช่วยในการปรับปรุงประสิทธิภาพและความเลือกเฉพาะของสารเคมีใหม่