Methyl 5-bromo-4-methylpyrimidine-2-carboxylate ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางสำคัญสำหรับการพัฒนาสารเคมีที่ซับซ้อนมากขึ้น โครงสร้างของมันทำให้มีคุณค่าในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม ซึ่งทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับการสังเคราะห์ส่วนผสมยาสำคัญ (APIs) ต่างๆ โดยเฉพาะใช้ในการเตรียมอนุพันธ์ไพรีมีดีน ซึ่งมักถูกสำรวจสำหรับคุณสมบัติทางรักษาที่มีศักยภาพ เช่น กิจกรรมต้านไวรัส ต้านมะเร็ง หรือต้านการอักเสบ นอกจากนี้ สารนี้ยังถูกใช้ในสถานที่วิจัยเพื่อศึกษากลไกปฏิกิริยาและพัฒนาเส้นทางสังเคราะห์ใหม่สำหรับสารประกอบเฮเทอโรไซคลิก กลุ่มฟังก์ชันบรอมโมและเอสเตอร์ทำให้เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาที่หลากหลายสำหรับการปรับเปลี่ยนทางเคมีเพิ่มเติม รวมถึงปฏิกิริยาครอส-คัปพลิงและการแทนที่นิวคลีโอฟิลิก