6-Chloro-2-(trifluoromethyl)pyrimidin-4-amine เป็นสารเคมีที่ใช้หลักในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเกษตรเคมี ในเภสัชกรรม สารนี้ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) ต่างๆ โดยเฉพาะที่กำหนดเป้าหมายไปยังเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะในแอปพลิเคชันบำบัด กลุ่ม trifluoromethyl และ chloro ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีคุณค่าสำหรับพัฒนาสารประกอบที่มีกิจกรรมชีวภาพและความเสถียรที่เพิ่มขึ้น

ในเกษตรเคมี ใช้ในการสร้างยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช โครงสร้างแกน pyrimidine ช่วยในการพัฒนาสารประกอบที่ยับยั้งการเจริญเติบโตของพืชหรือศัตรูพืชที่ไม่ต้องการได้อย่างมีประสิทธิภาพ ส่งผลให้ปรับปรุงการป้องกันพืชและผลผลิต คุณสมบัติทางเคมีช่วยในการออกแบบโมเลกุลที่มีการกระทำแบบเลือกสรร ลดผลกระทบต่อสิ่งแวดล้อม

นอกจากนี้ ยังใช้ในการวิจัยและพัฒนาเป็นสารตั้งต้นสำหรับสังเคราะห์โมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น ช่วยในการค้นพบยาใหม่หรือสารเกษตรเคมี ความหลากหลายและปฏิกิริยาของสารนี้ทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีคุณค่าในการสังเคราะห์อินทรีย์และการใช้งานอุตสาหกรรม