สารประกอบนี้ถูกนำมาใช้หลักๆ ในสาขาเคมีทางการแพทย์เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพต่างๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนายับยั้งคินาส ซึ่งมีความสำคัญในการกำหนดเป้าหมายเอนไซม์เฉพาะที่เกี่ยวข้องกับโรค เช่น มะเร็งและโรคอักเสบ นอกจากนี้ยังทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสร้างยาใหม่ โดยเฉพาะยาที่มุ่งปรับเปลี่ยนการโต้ตอบระหว่างโปรตีนหรือกิจกรรมของเอนไซม์ ส่วนของไพรีมีดีนและไพรีดีนทำให้เป็นโครงสร้างที่หลากหลายสำหรับการค้นพบยา สามารถออกแบบโมเลกุลที่มีการประยุกต์ใช้ทางรักษาได้