ใช้หลักๆ ในงานวิจัยและพัฒนายาเภสัชกรรม สารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพต่างๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการสร้างยาที่มีฐาน pyrimidine ซึ่งมักใช้ในยาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการพัฒนาสารเคมีเกษตร ช่วยในการออกแบบสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง กลุ่มฟลูออรีนและเมทอกซีช่วยเพิ่มปฏิกิริยาและความสามารถในการจับคู่ ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายในการสังเคราะห์อินทรีย์