4-Pyrimidineacetic acid ethyl ester ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางที่หลากหลายสำหรับการผลิตเภสัชภัณฑ์และสารประกอบชีวภาพต่างๆ โครงสร้างแกนพีรีมีดีนของมันทำให้มีคุณค่าในการพัฒนายาต้านไวรัส ยาต้านมะเร็ง และยาต้านการอักเสบ นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์อนุพันธ์นิวคลีโอไซด์ ซึ่งมีความสำคัญยิ่งในการวิจัยยาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง สารประกอบนี้ยังทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในการเตรียมสารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิก สนับสนุนความก้าวหน้าในการเคมียารักษาและการค้นพบยา หน้าที่เอสเตอร์ของมันช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนทางเคมีเพิ่มเติมได้ ส่งเสริมประโยชน์ในการสร้างโมเลกุลซับซ้อนที่มีการประยุกต์ใช้ทางบำบัดที่เป็นไปได้