4-Methyl-2-(methylsulfonyl)pyrimidine ถูกนำมาใช้หลักๆ ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมเป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยาต่างๆ โดยเฉพาะยาที่มุ่งเป้าไปที่โรคระบบประสาทส่วนกลาง โครงสร้างของมันมีคุณค่าในการพัฒนาสารประกอบที่มีศักยภาพในการรักษา เช่น ยาต้านชักหรือสารป้องกันประสาท นอกจากนี้ยังทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในเคมีอินทรีย์สำหรับสร้างโมเลกุลซับซ้อนในการวิจัยทางการแพทย์ กลุ่มซัลโฟนิลของมันช่วยเพิ่มปฏิกิริยา ทำให้มีประโยชน์ในปฏิกิริยาการจับคู่ข้ามและกระบวนการสังเคราะห์อื่นๆ