2-(Methylthio)pyrimidine-4,5,6-triamine เป็นสารเคมีที่ใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะอย่างยิ่งในกระบวนการผลิตยาต้านมะเร็งและยาต้านไวรัส สารนี้มีบทบาทสำคัญในฐานะสารตั้งต้นหรือสารกลางในการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยโครงสร้างของมันช่วยในการพัฒนายาที่กำหนดเป้าหมายไปยังเส้นทางชีวภาพเฉพาะ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการรักษาการติดเชื้อและมะเร็งบางชนิด โครงสร้างแกนไพรีมีดีนของสารนี้มักถูกปรับเปลี่ยนเพื่อสร้างอนุพันธ์ที่ยับยั้งเอนไซม์หรือรบกวนการสังเคราะห์กรดนิวคลีอิก ทำให้เป็นส่วนประกอบสำคัญในการค้นคว้ายา นอกจากนี้ยังมีการศึกษาเพื่อนำไปใช้ในการพัฒนายาใหม่ๆ ที่มีประสิทธิภาพสูงในการรักษาโรคติดเชื้อและโรคทางพันธุกรรมอีกด้วย นอกจากนี้ สารนี้ยังนำไปประยุกต์ใช้ในการวิจัยสารเคมีเกษตรสำหรับการพัฒนายาฆ่าหญ้าทำลายพืชและยาฆ่าแมลง ซึ่งอนุพันธ์ของมันสามารถรบกวนกระบวนการเมแทบอลิซึมในสิ่งมีชีวิตเป้าหมาย และยังมีความยืดหยุ่นในการสังเคราะห์เคมีที่ขยายไปสู่การผลิตสีย้อมและสารเคมีพิเศษอื่นๆ