2-methylsulfanylpyrimidine-4-carbonitrile เป็นสารเคมีที่นิยมใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่มีความซับซ้อน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม มักถูกใช้เป็นสารตั้งต้นหรือ intermediate ในการผลิตยาหรือสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากโครงสร้างของมันสามารถทำปฏิกิริยาได้หลากหลายและนำไปสู่การสร้างโมเลกุลใหม่ที่มีศักยภาพทางการแพทย์ โดยเฉพาะในการสังเคราะห์สารประกอบเฮเทอโรไซคลิกซึ่งมีความสำคัญในเคมียารักษาเพื่อออกแบบยาที่มีคุณสมบัติบำบัด นอกจากนี้ ยังใช้เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสร้างสารเคมีเกษตร เช่น ยาฆ่าแมลงหรือยาฆ่าหญ้า ความหลากหลายในการทำปฏิกิริยาทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีประโยชน์ในงานวิจัยและการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรมที่มุ่งค้นหาสารชีวภาพใหม่