ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะตัวยาต้านโฟเลตและยาต้านจุลชีพ โครงสร้างของมันช่วยในการสร้างโมเลกุลชีวภาพที่มีฐานพิริไมดีน ซึ่งสำคัญในการกำหนดเป้าหมายเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์นิวคลีโอไทด์ ใช้บ่อยในเคมียารักษาเพื่อออกแบบตัวยับยั้งที่รบกวนเส้นทางเมแทบอลิซึมในพยาธิหรือเซลล์มะเร็ง นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยสารเคมีเกษตรเพื่อพัฒนาสารกำจัดวัชพืชและสารควบคุมการเจริญเติบโตของพืช เนื่องจากสามารถเลียนแบบเมแทบอลิไทต์พิริไมดีนตามธรรมชาติ