ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในเคมีเภสัชกรรมสำหรับการสร้างโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ ใช้กันทั่วไปในปฏิกิริยาครอส-คัปเปลิงและการแปลงโครงสร้างเฮเทอโรไซคลิกเพื่อนำแกนพิริมีดีนเข้าไปในผู้สมัครยา นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยด้านเกษตรเคมีสำหรับการออกแบบยาฆ่าแมลงชนิดใหม่ที่มีความเสถียรทางเมแทบอลิซึมที่ดีขึ้น เนื่องจากมีกลุ่มไตรฟลูออโรมิทิล