ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการผลิตสารกำจัดวัชพืชแบบเลือกสรร กลุ่มอัลดีไฮด์ที่ทำปฏิกิริยาได้และโครงสร้างคลอโรไพริมิไดนช่วยให้สามารถปรับแต่งเพื่อสร้างส่วนประกอบที่ใช้งานในการยับยั้งกระบวนการเจริญเติบโตของพืชเฉพาะ นอกจากนี้ยังใช้ในเคมียารักษาเพื่อสร้างโมเลกุลชีวภาพที่ขึ้นอยู่กับไพริมิไดน รวมถึงตัวยับยั้งคินาสที่มีศักยภาพ ความหลากหลายของสารนี้ทำให้มีคุณค่าในการพัฒนาตัวแทนป้องกันพืชและสารนำยาเภสัชภัณฑ์