ใช้เป็นสารตั้งต้นหลักในการสังเคราะห์ยาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase โครงสร้างของสารนี้ประกอบด้วยหมู่ไฮดรอกซิเมทิลและหมู่เมทิลไทโอที่ตำแหน่ง pyrimidine ทำให้สามารถดัดแปลงได้อย่างเลือกสรร มีคุณค่าในเคมีเภสัชกรรมสำหรับการออกแบบยาที่เล็งเป้าไปยังเส้นทางส่งสัญญาณเฉพาะในเซลล์มะเร็ง ใช้กันทั่วไปในงานวิจัยเพื่อปรับปรุงสารนำร่อง เนื่องจากมีปฏิกิริยาที่เหมาะสมและช่วยเพิ่มความสัมพันธ์การจับกับโปรตีนเป้าหมาย นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมอนุพันธ์เบสไพรีมีดีนที่มีศักยภาพในการออกฤทธิ์ต่อเชื้อไวรัสที่ดื้อยา