ใช้ในอุตสาหกรรมยาเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยาต้านไวรัส โดยเฉพาะยาที่ออกฤทธิ์ต่อไวรัสเริมและไวรัสเอชไอวี สารนี้มีโครงสร้างที่คล้ายกับเบสของกรดนิวคลีอิก ทำให้สามารถรบกวนกระบวนการจำลองตัวของไวรัสได้ จึงถูกนำมาใช้พัฒนายาที่มีฤทธิ์ยับยั้งการแพร่พันธุ์ของไวรัส นอกจากนี้ยังมีการศึกษาเพื่อประยุกต์ใช้ในยาต้านมะเร็ง โดยเฉพาะในการรบกวนการสังเคราะห์ดีเอ็นเอของเซลล์มะเร็ง นอกจากนี้ยังนำมาใช้ในการวิจัยเพื่อออกแบบยาใหม่ที่ขึ้นอยู่กับไพรีมีดีน โดยมุ่งเป้าไปที่การยับยั้งเอนไซม์ และแสดงศักยภาพในการประยุกต์ใช้ในด้านเกษตรเคมีในฐานะสารตั้งต้นสำหรับยาฆ่าหญ้าและสารควบคุมการเจริญเติบโตของพืช