ใช้ในสังเคราะห์สารประกอบที่มีโครงสร้างพิริมิดีน ซึ่งเป็นสารตั้งต้นสำคัญในการพัฒนายาในกลุ่มยาต้านจุลชีพ ยาต้านไวรัส และยาต้านมะเร็ง โดยเฉพาะในกระบวนการสร้างอนุพันธ์ของพิริมิดีนที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพสูง นอกจากนี้ยังใช้เป็นตัวกลางในการวิจัยและพัฒนาสารใหม่ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม เนื่องจากหมู่คลอไรด์และแอมายด์ที่ตำแหน่ง 6 และ 4 ทำให้สามารถทำปฏิกิริยาต่อได้ง่ายกับสารประกอบอื่นๆ เพื่อสร้างสารที่มีโครงสร้างซับซ้อนมากขึ้น