ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร โดยเฉพาะยาฆ่าหญ้าและยาฆ่าเชื้อรา เนื่องจากสามารถทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับสารออกฤทธิ์ที่ซับซ้อนมากขึ้นซึ่งมีฐานเป็นไพรีมีดีน โครงสร้างของมันสนับสนุนการพัฒนาสารประกอบที่มีกิจกรรมเลือกสรรต่อการเจริญเติบโตของพืชและเชื้อราที่ไม่พึงประสงค์ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมยาเภสัชภัณฑ์ที่ต้องการโครงสร้าง chloro-methoxy pyrimidine สำหรับการยับยั้ง kinase หรือเป้าหมายทางชีวภาพอื่นๆ ใช้กันทั่วไปในงานวิจัยและพัฒนาสำหรับการสร้างสารประกอบใหม่ในเคมียารักษาและเคมีเกษตร