ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนหน้าที่ได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในเคมีเภสัชวิทยาสำหรับการสร้างส่วนประกอบที่ใช้งานได้ในการค้นพบยาใหม่ นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมเคมีเกษตรในการสร้างสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง เนื่องจากสามารถรบกวนเส้นทางเมแทบอลิซึมในศัตรูพืชและวัชพืชได้ โดยเฉพาะเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารกำจัดวัชพืชในกลุ่มไทริโอโลไพรีมีดีน ซึ่งมีประสิทธิภาพต่อวัชพืชใบกว้างในพืชไร่ เช่น ข้าวโพดและถั่วเหลือง สารนี้ช่วยเพิ่มความสามารถในการดูดซึมและคงตัวในพืชเป้าหมาย ทำให้สารกำจัดวัชพืชมีประสิทธิภาพสูงขึ้นและใช้ในอัตราต่ำได้ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเพื่อออกแบบสารประกอบไพรีมีดีนใหม่ที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ