ใช้ในการสังเคราะห์ยาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง โดยเฉพาะอย่างยิ่งเป็นสารกลางในการเตรียมอนุพันธ์นิวคลีโอไซด์ที่ขึ้นอยู่กับไพรีมีดีน ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในเคมียารักษาโรคสำหรับพัฒนาสารประกอบที่รบกวนการจำลองไวรัสหรือการเพิ่มจำนวนเซลล์มะเร็ง นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยสำหรับการปรับเปลี่ยนส่วนประกอบกรดนิวคลีอิกเพื่อศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม กลุ่มฟังก์ชันคลอโรและเมทิลของมันช่วยให้สามารถทำการแทนที่แบบเลือกได้ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างอนุพันธ์ที่หลากหลายสำหรับการค้นพบยา