ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase สำหรับการรักษามะเร็ง เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการเตรียมส่วนประกอบยาที่มีฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) เนื่องจากความสามารถในการก่อตัวพันธะไฮโดรเจนและมีส่วนร่วมในการจับแบบเลือกสรรกับเป้าหมายทางชีวภาพ ใช้อย่างแพร่หลายในเคมียาสำหรับการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม (SAR) โดยเฉพาะในการปรับปรุงตัวยาต้านมะเร็งและยาต้านการอักเสบ นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยสารเคมีเกษตรเพื่อออกแบบยาฆ่าแมลงชนิดใหม่ที่มีประสิทธิภาพและความเลือกสรรที่ดีขึ้น ด้วยโครงสร้างที่มีหมู่อะมิโน คลอโร และนิโตรเจนในวงแหวน pyrimidine ทำให้มีศักยภาพในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม